Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms