Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Pdzd9Q9D9M4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Pdzd9Q9D9M4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms