Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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