Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsraQ9D6Y7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms