Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms