Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms