Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms