Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd2Q9D1L0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms