Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rfc5Q9D0F6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rfc5Q9D0F6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rfc5Q9D0F6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rfc5Q9D0F6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rfc5Q9D0F6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rfc5Q9D0F6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rfc5Q9D0F6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rfc5Q9D0F6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rfc5Q9D0F6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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