Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mms19Q9D071 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Mms19Q9D071 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Mms19Q9D071 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Mms19Q9D071 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Mms19Q9D071 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Mms19Q9D071 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms