Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms