Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc8Q9CYA6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms