Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Xrcc3Q9CXE6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Xrcc3Q9CXE6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Xrcc3Q9CXE6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Xrcc3Q9CXE6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Xrcc3Q9CXE6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Xrcc3Q9CXE6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Xrcc3Q9CXE6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Xrcc3Q9CXE6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Xrcc3Q9CXE6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Xrcc3Q9CXE6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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