Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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