Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ddx28Q9CWT6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ddx28Q9CWT6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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