Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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