Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Smurf1Q9CUN6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smurf1Q9CUN6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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