Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms