Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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