Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms