Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms