Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Mrpl35Q9CQL6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Mrpl35Q9CQL6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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