Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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