Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd2aQ9CQJ1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms