Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Chchd1Q9CQA6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Chchd1Q9CQA6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Chchd1Q9CQA6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Chchd1Q9CQA6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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