Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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