Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms