Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms