Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ms4a4dQ99N05 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms