Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms