Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CalcbQ99MP3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms