Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PtprtQ99M80 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PtprtQ99M80 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PtprtQ99M80 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms