Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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