Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms