Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TrabdQ99JY4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TrabdQ99JY4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TrabdQ99JY4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TrabdQ99JY4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TrabdQ99JY4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TrabdQ99JY4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TrabdQ99JY4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TrabdQ99JY4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TrabdQ99JY4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TrabdQ99JY4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TrabdQ99JY4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TrabdQ99JY4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TrabdQ99JY4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TrabdQ99JY4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TrabdQ99JY4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TrabdQ99JY4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TrabdQ99JY4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TrabdQ99JY4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TrabdQ99JY4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TrabdQ99JY4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TrabdQ99JY4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TrabdQ99JY4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TrabdQ99JY4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TrabdQ99JY4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TrabdQ99JY4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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