Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms