Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms