Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx18Q91ZR2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms