Protein–RNA interactions for Protein: Q91VR2

Atp5c1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5c1Q91VR2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5c1Q91VR2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms