Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms