Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Dnajc28Q8VCE1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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