Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms