Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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