Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga1Q8R0H9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms