Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pitrm1Q8K411 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pitrm1Q8K411 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pitrm1Q8K411 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pitrm1Q8K411 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pitrm1Q8K411 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pitrm1Q8K411 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pitrm1Q8K411 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pitrm1Q8K411 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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