Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms