Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms