Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms