Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1M4

Glis1, Zinc finger protein GLIS1, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis1Q8K1M4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Glis1Q8K1M4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Glis1Q8K1M4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms