Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms